При продаже товаров через структурное подразделение счета-фактуры должны выставляться от имени головной организации. Об этом Минфин сообщил в письме от 4 мая 2006 г. № 03-04-09/08. Дело в том, что согласно пункту 3 статьи 169 Налогового кодекса обязанность составлять счета-фактуры возложена на плательщиков НДС. В то же время из статьи 143 Кодекса следует, что ими признаются лишь юридические лица, коими обособленные подразделения не являются.

Таким образом, при заполнении счетов-фактур по товарам, реализованным подразделениями, в строках 2 «Продавец» и 2а «Адрес» нужно указать реквизиты головной организации. В строке 2б «ИНН/КПП продавца» – КПП соответствующего структурного подразделения, а в строке 3 «Грузоотправитель и его адрес» – наименование и адрес подразделения.